A história de Parallel acontece há milhares de anos no futuro, mas ela começa na Terra durante o presente ou num futuro bem próximo. A Terra está se esgotando de recursos e a energia se torna uma mercadoria escassa. Os cientistas, desesperados por uma solução, tentam usar uma nova forma de fissão que utiliza antimatéria. O experimento fracassa, causando um desastre global, inicialmente referido como “O Evento”. Um novo tipo de radiação se espalha por todo o planeta, resultando em bilhões de mortes de humanos e animais.
A humanidade se depara com um evento de extinção global. O pouco que resta de tempo é usado para construir três naves, conhecidas como as Naves do Gênesis, para evacuar sobreviventes em massa do planeta. Uma nave dirige-se a Marte, uma para Europa (Lua de Júpiter) e a última para o cinturão de asteroides.
Milhares de anos após O Evento, a humanidade ainda sobrevive em cinco linhagens diferentes chamadas de “Parallels”. O Evento passa a ser conhecido como “The Priming” para aqueles que sobreviveram. A Terra novamente se torna habitável. Ao redor do planeta uma nova fonte de energia é encontrada é chamada de “Prime”. Os cinco Paralelos entram em conflito pelo controle da terra e por este novo recurso.
Os Earthen: Durante O Priming, foi descoberto que alguns humanos tinham imunidade a radiação criada. Enquanto bilhões morreram, os imunes sobreviveram. Os Earthen são os descendentes dos sobreviventes deixados para trás na Terra durante o Êxodo. Os Earthen são proponentes do naturismo e tem uma conexão profunda com o meio ambiente. Após séculos vivendo com a radiação, os Earthen evoluíram de uma forma que eles conseguem manipular a energia do Prime usando seus corpos.
Os Marcolians: Durante o Êxodo, a nave chamada de Soleil Rouge (Sol Vermelho) atravessou o vão espacial até Marte onde já existia uma colônia de pesquisas científicas. Os refugiados do Soleil Rouge se juntaram aos colonos marcianos e formaram uma nova sociedade centrada em pilares da ciência e normas militares. Os seus descendentes se chamam Os Marcolians.
Os Kathari: A nave Artemis Proxima teve como destino Europa, uma das luas de Júpiter. Em Europa, os refugiados construíram uma cidade embaixo da capa de gelo que cobre a lua. Um ato terrorista destruiu a capacidade da colônia em cultivar plantações de qualquer tipo. Os Kathari então se voltaram à engenharia genética para sobreviver, replicando comida e até corpos humanos. Os Kathari são os clones descendentes dos primeiros refugiados em Europa.
Os Augencore: A terceira nave a escapar durante O Evento foi a “The Fortitude”. A missão da Fortitude era não atrelar a sobrevivência da nave e seus passageiros a um planeta. Por isso a nave se move de asteroide para asteroide minerando recursos. Através das décadas, por causa da baixa gravidade, os corpos dos tripulantes começaram a sofrer e eles começaram a experimentar com cirurgias eletivas de alteração dos seus corpos. Eventualmente essas alterações mecânicas viraram um novo modo de vida dentro do Fortitude que ao longo do tempo foi renomeado de Caine-1. Os Augencore são descendentes dos primeiros tripulantes da Fortitude.
Os Shroud: Muito antes do “Priming”, foi enviada da Terra uma missão para um exoplaneta com características similares às da Terra chamado Kepler-1649c. A nave comissionada para a missão se chamava New Dawn. Durante a missão a nave foi afetada por um buraco negro. A New Dawn escapou do buraco negro, mas aonde ela foi parar é um mistério para todos menos a tripulação presente. Quando a New Dawn retornou séculos depois os tripulantes estavam mudados de formas incompreensíveis. Eles se tornaram Os Shroud.